海底地形测量和海道测量测得的海底地貌是有区别的，这是因为海底地形测量测得的数据用于编制海底地形图，而海道测量测得的数据用于编制航海图。海底地形图和航海图是两种性质完全不同的海图。

海底地形图表示海洋区域详细的各种要素，尤其是地形起伏要表示得真实、细致，使其可用于海洋研究、海洋工程建设和海洋开发利用的各个方面。航海图是一种用于保证航海安全的专用海图，对航海安全影响较大的浅海区、地形复杂区、正地貌等的测量比较详细、准确；而对航行比较安全的深海域、地形平坦海区、负地貌等的测量和表示较忽略。海底地形图上应表示任何海区的微地貌形态；而航海图上对微地貌的表示不太重视。在制图综合时，航海图对浅水区略作扩大表示，而对深水区，尤其是孤立的小凹坑常常舍去不表示。因而在研究海底地形、进行海洋工程建设的海洋活动时，应使用海底地形图，而不应用航海图。